Die funktionale Organisation ist nach dem strengen Ein-Linien-Prinzip aufgebaut, was dazu führt, dass viele Probleme auch von der operativen Ebene bis an die Leitungsspitze zur Entscheidung getragen werden. Vielfach findet eine geringe Entscheidungsdelegation auf die zweite Führungsebene statt. Durch die Abgrenzung der einzelnen Funktionen kommt es zu Bereichsegoismen, die zu Konflikten führen, die zumeist an die Leitungsspitze weitergegeben werden. Je größer das Unternehmen wird, desto größer wird dementsprechend auch die Problematik der Überlastung der Leitungsspitze.
